真核转录组测序
转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下所有转录本的总和,包括 mRNA 和非编码 RNA(即Non-coding RNA,如 tRNA,rRNAs,microRNAs,piRNAs 和 long ncRNAs 等)。转录组测序 (Transcriptome sequencing) 主要指通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的。mRNA,可以用来研究基因结构和基因定量分析,并预测新转录本,是深入研究转录组复杂性的强大手段和工具。目前,转录组测序已经被广泛应用于动植物发育阶段的研究、优良品种基因的筛选和疾病治疗等。
技术路线
送样建议
物种 |
浓度(Qubit) |
体积 |
总量 |
基因组完整性 |
真菌 total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;图谱基线无上抬,5S?峰正常
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其他动、植物total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;图谱基线无上抬,5S?峰正常
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原核 total RNA |
≥20ng/μL |
15μL-100 μL |
≥2μg |
RIN≥6.5 28S/18S≥1.0;图谱基线无上抬,5S?峰正常
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技术参数
有参转录组测序 |
测序策略 |
数据量 |
周期 |
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HiSeq4000 PE150 |
6G clean date |
45个自然日 |
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