细菌16S rDNA菌种鉴定
通过DNA测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速,准确。信诺金达公司提供的微生物物种鉴定服务包括细菌16srDNA鉴定和真菌ITS鉴定,通过PCR扩增16SrDNA,测序后在GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种菌种。信诺金达通过大量实验优化的通用引物适用于99%以上的微生物,鉴定成功率在98%以上。
服务要求
1.样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA。
2.如果样品为基因组DNA,DNA浓度>10ng/ul,体积大于20ul。
3.鉴定结果一般可以鉴定到种。个别菌种由于微生物数据库相关数据缺乏,只能鉴定到属。如遇这种情况,正常收费。
4.如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。
5.对于某些致病性菌体,请提前说明,注意保护工作人员健康及环境卫生。
服务基本流程
1.信诺金达进行引物设计合成;
2.PCR扩增16S rDNA;
3.PCR产物纯化;
4.测序,序列比对分析。
服务报告内容
实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图;
注:对于鉴定的菌株,我们不做备份及保留,请送检之前做好保种工作。
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